Regiones cloroplásticas como herramientas para la identificación molecular de Campomanesia xanthocarpa O. Berg. en Paraguay
Palabras clave:
Cloroplasto, Código de barras genético, guavira pytã, Campomanesia xhantocarpaResumen
El género Campomanesia (Myrtaceae) tiene varios representantes en Paraguay, entre los que se encuentran C. xanthocarpa (guavira pytã), especie destacada por su utilización en medicina tradicional y alimentación, y que junto con otras especies co-genéricas forma parte de la dieta de comunidades mbya guaraní. El objetivo de este trabajo fue seleccionar regiones cloroplásticas de C. xanthocarpa que puedan utilizarse para DNA barcoding y como herramientas para estudios filogeográficos. La búsqueda de secuencias disponibles en el GenBanK permitió identificar que hay disponibles solo 12 accesiones de regiones cloroplásticas para esta especie, ninguna correspondiente a especímenes de Paraguay. El análisis de las mismas permitió identificar cinco sitios polimórficos para C. xanthocarpa en secuencias del gen matk, pudiendo esta región ser utilizada para estudios filogeográficos. En las accesiones correspondientes al gen RuBisCO no se encontró ningún sitio polimórfico. El alineamiento con secuencias de especies cogenéricas identificó sitios que podrían ser específicos. Este análisis deja en evidencia la utilidad de estas regiones cloroplásticas y la
necesidad de analizar estas y otras, en poblaciones de Paraguay, de manera de identificar polimorfismos y sitios variables interespecíficos útiles para caracterizar poblaciones de esta especie, así como en la identificación y trazabilidad de la misma.
Descargas
Citas
PEREZ DE MOLAS, Lidia Forencia. Manual de Familias y Géneros de Árboles del Paraguay.
San Lorenzo, 2016. ISBN 9789253094028.
ROTMAN, Alicia D. Revisión del género Campomanesia en la Argentina (Myrtaceae).
Darwiniana. 1976. Vol. 20, no. 3/4, p. 327–340.
FAO. El estado de la biodiversidad para la alimentación y la agricultura. Informe de país:
Paraguay. 2017.
DUJAK, Marcelo, FERRUCI, M.S., VERA JIMENEZ, M., PINEDA, J., CHAPARRO, E. and
BRÍTEZ, M. Registros sobre las especies vegetales alimenticias utilizadas por dos
comunidades indígenas Mbyá-Guaraní de la Reserva Parque Nacional San Rafael, ItapúaParaguay. Steviana. 2015. Vol. 7, p. 25–47.
BARNI, M.M., DÍAZ LEZCANO, M.I. and VERA DE ORTÍZ, M. Composición florística y
abundancia de los bosques degradados del BAAPA. In : III Congreso Nacional de Ciencias
Agrarias. 2014. p. 408–410. ISBN 3494226636.
MYERS, Norman, MITTERMEIER, Russell A, MITTERMEIER, Cristina G, DA FONSECA, G A
B and KENT, Jennifer. Biodiversity hotspots for conservation priorities. Nature. 2000. Vol. 403,
no. 6772, p. 853–858. DOI 10.1038/35002501.
SEAM. Informe Nacional Áreas Silvestres Protegidas del Paraguay. 2007.
HOFNER, Johannes, KLEIN-RAUFHAKE, Theresa, LAMPEI, Christian, MUDRAK, Ondrej,
BUCHAROVA, Anna and DURKA, Walter. Populations restored using regional seed are
genetically diverse and similar to natural populations in the region. Journal of Applied Ecology,
, vol. 59, no 9, p. 2234-2244.
YANG, Jing, CAI, Lei, LIU, Detuan, CHEN, Gao, GRATZFELD, Joachim and SUN, Weibang.
China’s conservation program on Plant Species with Extremely Small Populations (PSESP):
Progress and perspectives. Biological Conservation. 1 April 2020. Vol. 244.
DOI 10.1016/j.biocon.2020.108535.
MORLEY, Stewart A., AHMAD, Niaz and NIELSEN, Brent L. Plant organelle genome
replication. Plants. 1 October 2019. Vol. 8, no. 10. DOI 10.3390/plants8100358.
SUNNUCKS, Paul. Efficient genetic markers for population biology. Trends in Ecology and
Evolution. 2000. Vol. 15, no. 5, p. 199–203. DOI 10.1016/S0169-5347(00)01825-5.
SCARCELLI, Nora. Population Genomics of Organelle Genomes in Crop Plants. 2020.
MORRIS, Ashley B, SHAW, Joey and ASHLEY MORRIS, Correspondence B. Markers in time
and space: A review of the last decade of plant phylogeographic approaches. Molecular
Ecology. 2018. Vol. 27, p. 2317–2333. DOI 10.1111/mec.14695.
MCCAULEY, D E. The use of chloroplast DNA polymorphism in studies of gene flow in plants.
Trends in ecology & evolution (Personal edition). 1995. Vol. 10, no. 5, p. 198–202.
DOI 10.1016/S0169-5347(00)89052-7.
CORNACINI, Maiara R., MANOEL, Ricardo O., ALCANTARA, Marcelo A.M., MORAES, Mário
L.T., SILVA, Edvaldo A.A., PEREIRA NETO, Leonel G., SEBBENN, Alexandre M., ROSSINI,
Bruno C. and MARINO, Celso L. Detection and application of novel SSR markers from
transcriptome data for Astronium fraxinifolium Schott, a threatened Brazilian tree species.
Molecular Biology Reports. 1 April 2021. Vol. 48, no. 4, p. 3165–3172. DOI 10.1007/s11033-
-06338-5.
BURGNOS CANTONI, Cinthia Noemí. Actividad antimicrobiana in vitro de los extractos
hidroalcohólicos y aceite esencial de Campomanesia xanthocarpa (guavirá). REVISTA
IMPACTO. 2021. Vol. 1, no. 1, p. 35–46.
HOMCZINSKI, Isabel, LERNER, Jocasta, PERES, Fabiana Schmidt Bandeira, GASPARIN,
Ezequiel, MACHADO, Sebastião Do Amaral and TAMBARUSSI, Evandro Vagner. Molecular
and quantitative genetic analysis of the neotropical tree Campomanesia xanthocarpa (Mart.) O.
Berg. Annals of Forest Research. 2022. Vol. 65, no. 1, p. 111–126.
DOI 10.15287/afr.2022.2223.
HALL, T.A. BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program
for Windows 95/98/NT. 1999. ISBN 0261-3166.
LIBRADO, P. and ROZAS, J. DnaSP v5: A software for comprehensive analysis of DNA
polymorphism data. Bioinformatics. 2009. Vol. 25, no. 11, p. 1451–1452.
DOI 10.1093/bioinformatics/btp187.
MACHADO, Lilian de Oliveira, VIEIRA, Leila Do Nascimento, STEFENON, Valdir Marcos,
FAORO, Helisson, PEDROSA, Fábio de Oliveira, GUERRA, Miguel Pedro and NODARI,
Rubens Onofre. Molecular relationships of campomanesia xanthocarpa within myrtaceae based
on the complete plastome sequence and on the plastid ycf2 gene. Genetics and Molecular
Biology. 2020. Vol. 43, no. 2, p. 1–14. DOI 10.1590/1678-4685-GMB-2018-0377.
PETRY, Vanessa Samara. VALIDAÇÃO DE MARCADORES MICROSSATÉLITES E ANÁLISE
DA DIVERSIDADE GENÉTICA EM POPULAÇÕES DE Campomanesia xanthocarpa (Mart.) O.
Berg Dissertação. . Universidade Federal de Santa Catarina, 2018.
DE LIMA, Renato A.Ferreira, DE OLIVEIRA, Alexandre Adalardo, COLLETTA, Gabriel Dalla,
FLORES, Thiago Bevilacqua, COELHO, Rubens L.Gayoso, DIAS, Pedro, FREY, Gabriel
Ponzoni, IRIBAR, Amaia, RODRIGUES, Ricardo Ribeiro, SOUZA, Vinícius Castro and CHAVE,
Jérôme. Can plant DNA barcoding be implemented in species-rich tropical regions? A
perspective from São Paulo State, Brazil. Genetics and Molecular Biology. 2018. Vol. 41, no. 3,
p. 661–670. DOI 10.1590/1678-4685-gmb-2017-0282.
BOLSON, Mônica, DE CAMARGO SMIDT, Eric, BROTTO, Marcelo Leandro and SILVAPEREIRA, Viviane. ITS and trnH-psbA as Efficient DNA Barcodes to Identify Threatened
Commercial Woody Angiosperms from Southern Brazilian Atlantic Rainforests. PLoS ONE.
Vol. 10, no. 12, p. 1–18. DOI 10.1371/journal.pone.0143049.
YU, Jing, XUE, Juan-Hua and ZHOU, Shi-Liang. New universal matK primers for DNA
barcoding angiosperms. Journal of Systematics and Evolution. 2011. Vol. 49, no. 3, p. 176–
TABERLET, Pierre, GIELLY, Ludovic, PAUTOU, Guy and BOUVET, Jean. Universal primers
for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA. Plant Molecula. 1991. Vol. 17,
p. 1105–1109.
BIENIEK, Wojciech, MIZIANTY, Marta and SZKLARCZYK, Marek. Sequence variation at the
three chloroplast loci (matK, rbcL, trnH-psbA) in the Triticeae tribe (Poaceae): comments on the
relationships and utility in DNA barcoding of selected species. Plant Systematics and Evolution.
April 2015. Vol. 301, no. 4, p. 1275–1286. DOI 10.1007/s00606-014-1138-1
